Introducción
Si eres autónomo y todavía facturas con Word, Excel o una plantilla descargada, tendrás que cambiar. Todos los autónomos y empresas deberán emitir sus facturas con un programa adaptado a VeriFactu, el sistema antifraude de Hacienda. La norma publicada fija el 1 de julio de 2027 para autónomos (1 de enero de 2027 para sociedades), pero el 5 de octubre de 2026 Hacienda anunció su aplazamiento a octubre de 2028, la misma fecha en que la factura electrónica será obligatoria para la mayoría de negocios. Hasta que el cambio se publique en el BOE, lo prudente es prepararse ya.
La buena noticia: hay opciones desde 0 €, y la mayoría de autónomos no necesita pagar más de 15–20 € al mes por un programa que, además de cumplir la ley, te ahorra horas cada trimestre.
En esta comparativa analizamos los seis programas de facturación más usados por autónomos en España. Te contamos cuánto cuestan de verdad, qué incluye cada uno, sus puntos débiles y cuál te conviene según tu tipo de actividad.
Respuesta rápida: cuál elegir
Si no tienes tiempo de leer todo, esta es nuestra recomendación según tu situación:
| Tu situación | Programa recomendado | Por qué |
|---|---|---|
| Empiezas y facturas a pocos clientes | FacturaDirecta (gratis) | Plan gratuito real con VeriFactu hasta 10 clientes |
| Facturas muy poco y no quieres pagar | Contasimple (gratis) | Plan gratuito permanente con VeriFactu |
| Quieres lo más barato de pago | Billin o Anfix | Desde unos 5–7 € al mes |
| Quieres llevar tú mismo tus impuestos | Quipu | Facturas, gastos y modelos trimestrales en un solo panel |
| Vas a contratar, vender productos o crecer | Holded | ERP completo: no tendrás que cambiar de programa |
| Tu gestoría ya usa un programa concreto | El de tu gestoría | Ahorras tiempo a ambos (a menudo Anfix o Sage) |
Nuestra elección general para un autónomo de servicios: Quipu, por equilibrio entre precio, sencillez y ayuda con los impuestos.
Tabla comparativa: precios y funciones
| Programa | Plan de entrada (sin IVA) | Límite del plan de entrada | Plan gratis | Prueba gratis | VeriFactu | Ideal para |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Holded | Plus: 15 €/mes (50 % los 3 primeros meses) | 250 facturas al año, 1 usuario | No | 14 días | Sí | Autónomos que van a crecer |
| Quipu | Starter: 17 €/mes (8,50 € los 3 primeros meses) | Facturas ilimitadas, 30 escaneos OCR al mes | No | 15 días | Sí | Autónomos que llevan sus impuestos |
| Billin | Básico: 6,60 €/mes en pago anual (8 € mensual) | Facturas ilimitadas, pocos clientes y escaneos | No | 30 días | Sí, también TicketBAI | Quien solo quiere facturar barato |
| Anfix | Desde unos 5–6 €/mes en pago anual | Unas 60 facturas al año en el plan básico | No | Sí | Sí | Autónomos cuya asesoría usa Anfix |
| Contasimple | Profesional: 10,95 €/mes en pago anual | Plan gratis con pocos documentos al año | Sí | — | Sí | Actividad ocasional |
| FacturaDirecta | Gratis | 10 clientes y 10 productos | Sí | — | Sí | Autónomos que empiezan |
Cómo leer los precios. Todos son sin IVA (súmale un 21 %). Varios programas anuncian el precio del pago anual o el de la promoción de los tres primeros meses; a partir del cuarto mes, o pagando mes a mes, pagarás la tarifa completa. Lo tienes en cuenta en el cálculo de coste anual más abajo.
Fuentes: página de precios de Holded y de Quipu, comparativas de Aikount (septiembre de 2026), Softabase (julio de 2026), Invoo, Guía Fiscal y Guía de Software. Precios revisados el 7 de octubre de 2026; los fabricantes los cambian a menudo, así que confírmalos antes de contratar.
Qué debe tener un programa de facturación para autónomos en 2026
Antes de mirar marcas, comprueba estos siete puntos. Los tres primeros son imprescindibles; los demás marcan la diferencia en tiempo ahorrado.
Imprescindibles
- Adaptado a VeriFactu (RD 1007/2023). No existe una «certificación oficial» de la AEAT: lo que cuenta es la declaración responsable del fabricante, que debe estar publicada en su web o dentro del programa. Si no la encuentras, descártalo.
- Retención de IRPF en la factura. Si trabajas para empresas o profesionales, tus facturas llevan retención del 15 % (7 % los tres primeros años de actividad). El programa debe calcularla sola.
- Facturas rectificativas y series. Con VeriFactu no se pueden borrar ni modificar facturas emitidas: los errores se corrigen con una rectificativa. El programa debe hacerlo en dos clics y sin romper la numeración.
Muy recomendables
- Registro de gastos con lectura automática (OCR). Fotografías el ticket con el móvil y el programa extrae proveedor, base e IVA. Te ahorra una hora o más cada trimestre.
- Borrador de los modelos 303 y 130. Aunque los presente tu gestoría, ver cada mes cuánto IVA e IRPF te tocará pagar evita sustos.
- Acceso para tu gestoría. Que tu asesor entre en el programa en lugar de esperar a que le envíes un Excel.
- App móvil. Para emitir una factura o fotografiar un ticket en el momento.
Solo si tu negocio lo necesita
- Conexión bancaria y conciliación: útil a partir de 20–30 cobros al mes.
- TicketBAI: obligatorio si tienes tu domicilio fiscal en el País Vasco (allí no aplica VeriFactu).
- Inventario y TPV: si vendes productos físicos.
- Facturas recurrentes: si cobras cuotas mensuales a los mismos clientes.
Análisis de cada programa
1. Quipu: el mejor para la mayoría de autónomos
Quipu (grupo TeamSystem) está diseñado alrededor de la pregunta que todo autónomo se hace cada trimestre: ¿cuánto tengo que pagar? Su panel principal muestra ingresos, gastos y la previsión de IVA e IRPF en tiempo real.
Precios. Starter 17 €/mes, Solution 30 €/mes y Premium 59 €/mes, sin IVA. Suele lanzar un 50 % de descuento los tres primeros meses (Starter a 8,50 €). Prueba gratuita de 15 días.
Qué incluye el plan Starter. Facturas y presupuestos ilimitados, VeriFactu, 30 lecturas automáticas de tickets al mes, previsión de impuestos, app móvil y asistente de IA. La conexión y conciliación bancaria empiezan en Solution.
Lo mejor.
- Muy fácil de aprender: en una tarde lo tienes funcionando.
- Borradores de los modelos fiscales del autónomo integrados.
- Integraciones con Stripe, PayPal, Shopify, WooCommerce y con programas de gestorías como A3 o Sage.
Lo peor.
- Sin plan gratuito.
- La conciliación bancaria no está en el plan de entrada.
- No gestiona stock ni proyectos complejos.
Elígelo si eres autónomo de servicios sin empleados y quieres tener los impuestos bajo control.
2. Holded: el más completo, para crecer
Holded es un ERP en la nube: facturación, contabilidad, CRM, proyectos, equipo e inventario en una sola herramienta. Es el programa de gestión más conocido entre pymes españolas.
Precios. Plus 15 €, Básico 29 €, Estándar 59 €, Avanzado 99 € y Premium 199 € al mes, sin IVA, con un 50 % de descuento los tres primeros meses y 14 días de prueba sin tarjeta. Inventario, TPV, fabricación y nóminas son módulos de pago aparte (inventario y TPV desde 25 €/mes; nóminas, 5 € por empleado).
Ojo con el plan Plus. Es el más barato, pero tiene un tope de 250 facturas al año y un solo usuario. Si emites más de 20 facturas al mes, necesitarás el Básico (29 €, hasta 1.000 facturas y 2 usuarios).
Lo mejor.
- Escala sin migrar: de autónomo a pyme con empleados.
- Interfaz muy cuidada y automatizaciones potentes.
- Acceso para la asesoría incluido en todos los planes.
Lo peor.
- Caro para un autónomo que solo factura, sobre todo a partir del cuarto mes.
- Los módulos extra encarecen mucho el coste real.
- Más curva de aprendizaje por la cantidad de funciones.
Elígelo si prevés contratar, vender productos o tener una sociedad en los próximos dos años.
3. Billin: lo más barato para solo facturar
Billin (comercializado como TeamSystem Facturas Billin) se centra en emitir y cobrar facturas, y lo hace con mucha sencillez.
Precios. Básico 6,60 €/mes, Pro 14 €/mes e Ilimitado 23 €/mes en pago anual, sin IVA; pagando mes a mes, el Básico sube a 8 €. Prueba gratuita de 30 días, la más larga de esta comparativa. No tiene plan gratuito permanente.
Lo mejor.
- Facturas VeriFactu, Facturae (administración pública) y TicketBAI ilimitadas en todos los planes.
- Avisa cuando el cliente abre la factura, permite pasarela de pago y facturas recurrentes.
- Tu gestor puede entrar en tu cuenta para preparar los trimestres.
Lo peor.
- El plan Básico solo admite 5 clientes y 5 escaneos de gastos al mes; el Pro, hasta 50 clientes.
- La parte de impuestos y contabilidad es más ligera que en Quipu u Holded.
Elígelo si tu gestoría hace los impuestos y tú solo necesitas facturar bien y barato. Es también una de las mejores opciones si facturas en el País Vasco.
4. Anfix: ideal si tu asesoría lo usa
Anfix combina facturación y contabilidad con un portal compartido entre autónomo y asesor, en tiempo real.
Precios. Desde unos 5–6 € al mes en pago anual; a mes suelto cuesta aproximadamente el doble. El plan básico tiene un tope de unas 60 facturas al año, así que la mayoría de autónomos activos necesitarán un plan superior.
Lo mejor. Colaboración fluida con la asesoría y precio de entrada muy bajo.
Lo peor. Plan básico muy limitado e interfaz menos intuitiva que la de Quipu o Holded.
Elígelo si tu gestoría trabaja con Anfix: ambos ahorraréis tiempo cada trimestre.
5. Contasimple: el gratuito veterano
Contasimple (grupo Cegid) lleva años siendo la opción de bajo coste para autónomos.
Precios. Plan Básico gratuito con VeriFactu y presentación de impuestos, pero limitado a 12 documentos al año (facturas y gastos suman). El plan Profesional cuesta 10,95 €/mes en pago anual (12,95 € en pago trimestral), con 500 documentos al año y los modelos del autónomo.
Lo mejor. De los más baratos del mercado con modelos fiscales incluidos.
Lo peor. Diseño menos moderno y un plan gratis que se queda corto si facturas todos los meses.
Elígelo si tu actividad es ocasional o estás probando una idea de negocio.
6. FacturaDirecta: gratis para empezar
FacturaDirecta ofrece uno de los pocos planes gratuitos reales con VeriFactu: hasta 10 clientes y 10 productos.
Lo mejor. Interfaz clara, app móvil y paso sencillo a los planes de pago con contabilidad sin migrar datos.
Lo peor. Diez clientes se quedan cortos en cuanto la actividad despega.
Elígelo si acabas de darte de alta y facturas siempre a los mismos pocos clientes.
¿Y la aplicación gratuita de Hacienda?
La Agencia Tributaria ofrece una aplicación gratuita para emitir facturas que cumplen VeriFactu, sin límite de facturas. Es una opción válida y legal, pero conviene saber qué no hace:
- No registra gastos ni lee tickets.
- No conecta con tu banco ni controla qué facturas están cobradas.
- No calcula tus modelos 303 y 130.
- No envía las facturas por correo ni recuerda cobros pendientes.
Cuándo basta. Si emites muy pocas facturas al mes y tu gestoría se encarga de todo lo demás, la aplicación de la AEAT cubre la obligación legal sin coste.
Cuándo se queda corta. En cuanto quieras saber cuánto IVA te toca pagar, organizar gastos o cobrar sin perseguir a nadie, un programa de 7–17 € al mes te ahorrará más tiempo del que cuesta. Lo analizamos a fondo en Aplicación gratuita de la AEAT para facturar: límites y alternativas (enlace interno al art. 50).
Cuánto cuesta de verdad al año
El precio que ves anunciado suele ser el de promoción o el de pago anual. Esto es lo que pagarás realmente en el primer año (con la promoción de los tres primeros meses cuando existe) y a partir del segundo, sin IVA:
| Programa y plan | Primer año | Desde el segundo año |
|---|---|---|
| FacturaDirecta (gratis) | 0 € | 0 € |
| Anfix básico (anual) | unos 60–72 € | unos 60–72 € |
| Billin Básico (anual) | 79 € | 79 € |
| Contasimple Profesional | 131,40 € | 131,40 € |
| Billin Pro (anual) | 168 € | 168 € |
| Holded Plus | 158 € | 180 € |
| Quipu Starter | 179 € | 204 € |
| Holded Básico | 305 € | 348 € |
Cálculo propio con las tarifas de la tabla comparativa: 3 meses al 50 % y 9 meses a tarifa completa en Holded y Quipu; precio anual en Billin y Anfix.
Un detalle que reduce el coste real. Si estás en el régimen general de IVA, el IVA de la suscripción te lo deduces en el modelo 303, y la cuota es un gasto deducible en tu IRPF. Para un autónomo que tributa al 30 %, una cuota de 17 € al mes le cuesta en la práctica unos 12 €.
Cómo elegir según tu perfil
| Perfil | Facturas al mes | Recomendación | Coste aproximado |
|---|---|---|---|
| Recién dado de alta, pocos clientes | Menos de 5 | FacturaDirecta gratis o la aplicación de la AEAT | 0 € |
| Actividad ocasional o estacional | Muy pocas al año | Contasimple gratis | 0 € |
| Freelance con gestoría que hace los impuestos | 5–30 | Billin Básico (hasta 5 clientes) o Pro (hasta 50) | 7–14 €/mes |
| Autónomo que quiere llevar sus impuestos | 5–50 | Quipu Starter | 17 €/mes |
| Autónomo con mucho volumen y cobros bancarios | Más de 50 | Quipu Solution | 30 €/mes |
| Autónomo que va a contratar o vende productos | Cualquiera | Holded Básico | 29 €/mes |
| Autónomo del País Vasco | Cualquiera | Billin (TicketBAI incluido) | Desde 6,60 €/mes |
Cómo decidir en una tarde
- Elige dos candidatos de la tabla anterior según tu perfil.
- Abre la prueba gratuita de ambos el mismo día (no piden tarjeta en la mayoría).
- Haz la misma prueba en los dos: crea un cliente, emite una factura con retención de IRPF, emite una rectificativa y sube tres tickets.
- Mide el tiempo y quédate con el que te resulte más rápido y claro. En facturación, la herramienta que usas sin pensar es la que te ahorra dinero.
- Antes de pagar, pregunta a tu gestoría si trabaja con alguno: si es así, elige ese.
Preguntas frecuentes
¿Es obligatorio usar un programa de facturación siendo autónomo?
No es obligatorio usar un programa concreto, pero cualquier sistema con el que factures deberá cumplir VeriFactu: según la norma publicada, desde el 1 de julio de 2027; según el aplazamiento anunciado por Hacienda el 5 de octubre de 2026 (pendiente del BOE), desde octubre de 2028. Word, Excel o las plantillas en PDF dejarán de ser válidos para emitir facturas.
¿Cuál es el programa de facturación más barato para autónomos?
Gratis: FacturaDirecta (hasta 10 clientes), Contasimple (pocos documentos al año) o la aplicación de la AEAT. De pago, Anfix y Billin parten de unos 5–7 € al mes en pago anual.
¿Cuál es el mejor programa de facturación para autónomos?
Para la mayoría de autónomos de servicios, Quipu: equilibrio entre precio, facilidad de uso y ayuda con los impuestos. Si vas a crecer o tener empleados, Holded.
¿Qué diferencia hay entre Holded y Quipu?
Holded es un ERP completo (CRM, proyectos, inventario, equipo); Quipu se centra en facturación, gastos e impuestos del autónomo. Lo comparamos punto por punto en Holded vs Quipu (enlace interno al art. 3).
¿Cómo sé si un programa cumple VeriFactu?
Busca la declaración responsable del fabricante (RD 1007/2023). Todos los programas de esta comparativa la tienen. Las facturas que emitas mostrarán además un código QR y la mención «VERI*FACTU» si usas esa modalidad.
¿Puedo cambiar de programa más adelante?
Sí. La mayoría permite exportar e importar clientes, productos y facturas. Lo importante es mantener la numeración correlativa y conservar las facturas emitidas en el programa anterior durante el plazo legal.
¿Me puedo desgravar el programa de facturación?
Sí. La cuota es un gasto deducible de tu actividad en el IRPF y, si estás en el régimen general, también te deduces su IVA.
¿Qué pasa si vivo en el País Vasco?
Allí no aplica VeriFactu, sino TicketBAI (o Batuz en Bizkaia). Elige un programa compatible con TicketBAI, como Billin.